Perteneció al linaje de los Sarmientos, Condes de Salinas y a sus sucesores los Duques de Hijar. En la primera Guerra Carlista, este enclave fue importante al encontrarse en lo alto del monte los Payos un castillo o monasterio y una ruta conocida como “la de los carlistas”. Tiene como hijos ilustres a los Valdivielso, grandes escultores, conocidos como los Santeros de Payueta. Muchas de las imágenes que se encuentran en las iglesias o ermitas de Álava salieron de sus talleres.
Las casas se agrupan alrededor de la iglesia de San Juan Bautista. Payueta cuenta con varias fuentes, como la circular, al lado del juego de bolos cubierto. Un bonito paseo circunda parte del pueblo con unas magníficas vistas. Dentro del casco histórico y en un alto, en una pequeña explanada, está la ermita de San Roque y una gran cruz de hierro, con bancos y juegos para niños. Su caserío se ha expandido al construirse varias urbanizaciones. En la carretera que lleva de Payueta a Berganzo se encuentra el puente Cervera-Herrerias (1785).
Dentro del casco histórico y en un alto, en una pequeña explanada, está la ermita de San Roque y una gran cruz de hierro, con bancos y juegos para niños. Su caserío se ha expandido al construirse varias urbanizaciones. En la carretera que lleva de Payueta a Berganzo se encuentra el puente Cervera-Herrerias (1785).
La iglesia de San Juan Bautista es del siglo XVI, aunque ha experimentado reformas en épocas posteriores.
El pórtico abierto da acceso a la portada, de arco escarzado con molduras. La planta tiene forma de cruz latina, con paredes de piedra. La bóveda del ábside está adornada con nervaduras y rematada en círculos. En la clave que la remata figura la imagen de San Juan Bautista. Las bóvedas que cubren el resto de la nave son de crucería, muy decoradas con estrellas y adornos. El coro es de arco rebajado, con flores esculpidas en la piedra. La torre se construyó en 1170, muy esbelta y adornada. La cúpula está rematada en forma de cilindro.
El bonito retablo central acoge el sagrario, con dos grandes relieves a los lados. Preside el retablo entre columnas el titular de la iglesia, San Juan Bautista, acompañado por San Pedro y San Pablo. Remata el altar un hermoso relieve de la Asunción de Nuestra Señora. A los lados del altar mayor están las figuras de la Andra Mari Nuestra Señora de Cervera y San Juan. Los retablos laterales están dedicados a la Inmaculada Concepción y a San José, acompañados de varias imágenes.
